日本調剤の薬剤師の年収は？勤務区分ごとの初任給と昇給の仕組み

日本調剤の給与は、全国・ブロック・自宅のどの勤務コースを選ぶかで、初任給の段階から差がつく設計になっています。

この記事では、採用ページと有価証券報告書で確認できる金額だけを使って、勤務コース別の初任給、入社後に年収が上がる仕組み、仕事内容と休日の条件までを整理します。

日本調剤の企業概要

日本調剤は保険調剤薬局チェーンを主力とするヘルスケアグループで、700店舗以上を全国に展開しています（2026年10月1日時点）。グループの売上高は3,605億円です（2025年3月期・連結）。

出店の中身に特徴があります。大学病院・総合病院を中心とした門前薬局が全店舗の57.3%を占め、全国の大学病院の76.5%に出店しています（いずれも2026年3月末時点）。

抗がん剤や希少疾病薬といった専門性の高い処方を扱う機会が多く、これが後述する認定薬剤師の支援体制や手当にもつながっています。

在宅医療も規模が大きく、年間1件以上の在宅医療を実施した店舗は99.1%です（2025年度実績）。

門前薬局の比率が高い一方で、地域の在宅対応もほぼ全店舗で行っている構図です。

会社名	日本調剤株式会社
本社所在地	東京都港区芝5丁目33番11号 田町タワー9階（受付7階）
設立	1980年3月
グループ売上高	3,605億円（2025年3月期・連結）
薬局数	771店舗（2026年10月1日時点）
展開エリア	全国
主な事業	保険調剤薬局チェーンの運営。グループでは医薬品製造販売、医療従事者の人材紹介・派遣なども展開
在宅医療への対応	在宅医療の実施実績がある店舗の割合は99.1％（年間1件以上・2025年度実績）

グループには後発医薬品メーカーの日本ジェネリック、薬剤師の派遣・紹介を行うメディカルリソースも含まれ、薬局以外の部門へ異動する道もあります。

参考：日本調剤「数字で見る日本調剤」 ／ 日本調剤「会社概要」

日本調剤薬剤師の年収・待遇

正社員の年収（中途採用）

入社時点の金額も公開されています。新卒の初任給は280,000円〜410,000円（薬学部6年制卒）、中途採用のエリア勤務コースは月給250,000円〜500,000円（各種手当を含む・経験を考慮して決定）です。

パート・アルバイトの時給

日本調剤はパート薬剤師の時給を募集要項で公開していません。中途採用サイトに掲載されているのはエリア勤務コースの正社員のみで、パートの条件は店舗ごとの募集で確認する形になります。

目安をつくるなら、公開されている正社員の条件から逆算できます。年間休日121日を前提にすると年間の所定労働日数は244日、1日8時間で年1,952時間、月平均162.7時間です。中途採用の月給250,000円〜500,000円をこの時間で割ると時給換算で約1,540円〜3,070円になります。各種手当を含んだ月給を割った数字なので、基本給だけで比べればこれより低くなります。

医療キャリアナビ掲載求人データ（2026年時点）では、薬剤師のパート・アルバイト求人は518件で、調剤薬局の求人は1,124件ありました。時短勤務やブランク可の条件を明記する求人も一定数あり、勤務時間の希望を先に伝えて条件を出してもらう進め方が現実的です。

参考：日本調剤「有価証券報告書」 ／ 厚生労働省「第25回医療経済実態調査の報告(令和7年実施)」

日本調剤で年収が上がる仕組み

基本給と賞与の比率

新卒の初任給280,000円の内訳は、基本給245,000円と資格手当（薬剤師）35,000円です。基本給が月収の約88%を占め、残りは薬剤師免許に対する手当です。

ここに配属店舗ごとに設定される地域手当0円〜60,000円と、選んだコースに応じたコース手当が上に乗ります。

昇給は年1回（4月）、賞与は年2回（7月・12月）で、賞与の月数は公開されていません。

賞与と時間外手当がどれくらいの規模かは、有価証券報告書の平均年間給与から見当がつきます。初任給280,000円を12か月分にすると336万円ですが、正社員の平均年間給与は571万3千円です。差の約235万円のなかに、昇給を重ねた分と賞与、時間外手当が入ります。

平均年齢35.5歳なので月給自体も初任給より上がっており、賞与が占める割合はこの差額そのものより小さくなります。

役職・評価に連動する昇給

中途採用の募集要項には、昇給について「年1回（4月）※勤務成績に基づいておこなう」と明記されています。在籍年数だけで自動的に上がる形ではなく、評価が金額に反映される建て方です。

評価とは別に、取得した資格や修了した研修がそのまま月額の手当になる制度もあります。

外部認定の手当は月5万円なので、年間では60万円の差になります。資格を取ると年収がいくら動くかが金額で示されている点は、評価制度の中身が見えにくい企業と比べたときの判断材料になります。

勤務区分による給与差

日本調剤の新卒採用には、自宅コース・ブロックコース・全国コース・奨学金コースの4つの勤務コースがあります。このコース選択が、初任給の段階で金額に直結します。

差をつくっているのはコース手当です。全国コースには全国勤務手当が月40,000円支給され、年間では48万円になります。奨学金コースは奨学金の借入残高に応じた返済補助手当が月最大70,000円、3年間で最大252万円です。

住居の扱いも変わります。ブロックコース・全国コース・奨学金コースは借上社宅を使え、家賃の自己負担は2割です。自宅コースは借上社宅の対象外で、本人が世帯主の賃貸に住む場合に住宅手当が支給されます。

コース変更には期間の縛りがあります。ブロックコースから自宅コースへの変更は原則2年間できず、全国コースと奨学金コースは原則3年間変更できません。ただし結婚・出産・介護・本人の傷病を理由とする変更は期間内でも可能です。

管理薬剤師・エリアマネージャーへの昇格

昇格の金額インパクトを公的統計で見ると、第25回医療経済実態調査では保険薬局の管理薬剤師の年収は約725万円で、一般の薬剤師との差は約246万円です。日本調剤の管理薬剤師手当の金額は非公開ですが、役職に就くかどうかが年収の分かれ目になる構造は業界共通です。

昇格までの期間の実例も公開されています。採用サイトに載っている社員は2012年に新卒入社し、2015年に管理薬剤師になっています。入社4年目の時点です。その後は関西の大型店舗、病院敷地内薬局へと管理薬剤師のまま異動しています。

管理薬剤師の次はエリアマネージャーで、担当する課をマネジメントし、地域の医療機関や本部と薬局をつなぐ役割を担います。さらに上に支店長と薬剤部長があり、役職手当の対象範囲も広がっていきます。

キャリアの相談窓口として、上長であるエリアマネージャーとのキャリアアップ面談が年2回設定されています。希望を伝える機会が制度として確保されているぶん、昇格の時期を自分から動かしやすくなります。

参考：日本調剤「薬剤師 新卒採用」 ／ 日本調剤「募集要項」

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日本調剤薬剤師の仕事内容

中途採用の募集要項に書かれている業務内容は、保険調剤、在宅医療、OTC医薬品の販売管理、その他の店舗業務です。門前薬局が多いことと在宅の実施率が高いことから、1店舗で扱う範囲が広くなります。

調剤と服薬指導

大学病院・総合病院の門前が中心のため、がんや緩和ケアなど専門性の高い処方を応需する機会が多くなります。抗がん剤のレジメンや医療用麻薬の扱いに触れる場面も日常的です。

情報連携の仕組みが全店舗に入っています。トレーシングレポートは全店舗で実施し、患者さんの容体や処方内容を医師にフィードバックします。臨床検査値付き処方せんに対応するため、薬歴とリンクして検査値を入力・閲覧できる調剤システムも全店舗に整備されています。一部の店舗では応需病院と電子カルテを共有し、検査値・レジメン・アレルギー情報・既往歴を確認できます。

抗がん剤や医療用麻薬を服用している患者さんには、次回受診までの副作用や体調の変化を電話で確認するテレフォンフォローを定期的に行います。

OTC医薬品は全店舗で取り扱い、第一類医薬品も揃えています。500円均一の自社ブランド「5COINS PHARMA」の企画には薬剤師社員が関わっています。

在宅医療への対応

年間1件以上の在宅医療を実施した店舗は99.1%で、配属先を問わず在宅に関わる前提の体制です。

点滴や注射薬に対応するため、無菌調剤室とクリーンベンチを全国の店舗に導入中です。中心静脈栄養が必要な患者さんや、指定難病を持つ小児の在宅も受け入れており、退院時カンファレンスに薬剤師が参加する機会もあります。

医療用オピオイドの取り扱いや輸液ルートなどの医療材料の知識が求められるため、調剤室の中の業務だけで完結しないのが日本調剤の在宅の特徴です。

かかりつけ薬剤師としての業務

かかりつけ薬剤師が在籍している店舗の割合は81.6%です（2026年3月末時点）。5店舗のうち4店舗には該当する薬剤師がいる計算になります。

制度の枠組みは2026年4月に変わりました。令和8年度の診療報酬改定でかかりつけ薬剤師指導料とかかりつけ薬剤師包括管理料は廃止され、服薬管理指導料に統合されています。かかりつけ薬剤師が行った場合は服薬管理指導料1のイが45点、2のイが59点です。

担当するための要件は届出時点で次のすべてを満たすことです。

日本調剤の採用サイトでも、かかりつけ薬剤師は「薬局勤務3年以上に加え所定の研修等が必要」と説明されています。

参考：厚生労働省「令和８年度診療報酬改定について」 ／ 日本調剤「薬剤師 新卒採用」

日本調剤の働き方

勤務時間と残業

勤務時間は9:00〜18:00（店舗により異なる）、休憩60分で、月単位の変形労働時間制が採用されています。週平均40時間の枠内で運用する形です。

変形労働時間制は労働基準法32条の2に定められた仕組みで、あらかじめ決めた日ごとの所定労働時間が8時間を超えても、週平均が40時間以内なら割増賃金の対象になりません。逆に、所定より短い日も出てきます。シフト表に書かれた所定労働時間を先に確認しておくと、残業代の計算が読めるようになります。

残業時間の実績値は公表されていません。

ただし諸手当には時間外手当・休日出勤手当・年末年始出勤手当が並んでおり、休日出勤の有無は配属店舗によると募集要項に明記されています。面接では希望する店舗の処方箋枚数と人員体制を聞いておくのが無難です。

休日と有給の取りやすさ

年間休日は121日（1日平均8時間勤務した場合）で、これに夏季休暇2日が加わります。休日の取り方は週休2日制で、日曜・祝日とその他1日という組み合わせです。門前薬局が中心のため、日曜と祝日が休みになりやすい設計です。

有給休暇は初年度10日が付与され、そのうち5日は取得が必須です。これは労働基準法39条7項で、年10日以上付与される労働者に会社が時季を指定して5日取らせる義務があるためで、法律上の下限にあたります。

医療キャリアナビ掲載求人データと見比べると、121日という条件は薬剤師求人全体のなかでは上位に入ります。

転勤の範囲

転勤の範囲はコースで決まります。自宅コースは自宅から通える範囲（90分以内）に限られ、ブロックコースは新卒入社時に選んだ1ブロック内全域が対象です。選んだブロック自体の変更はできません。

出典：日本調剤株式会社 薬剤師中途採用｜働く環境・福利厚生

全国コースは全国各地が対象ですが、初任地についてはエリア（東日本・西日本・全域）と店舗タイプ（門前・敷地内／指定なし）を指定できます。行き先を完全に会社任せにしない余地が残されています。

転居を伴う異動には費用面のサポートが用意されています。

全国コースと奨学金コースには、独身者を対象に帰省のための交通費が年2回まで、1回10万円を上限に実費支給されます。

参考：e-Gov法令検索「労働基準法」 ／ 日本調剤「薬剤師 新卒採用」

福利厚生と研修制度

住宅・家族に関する制度

借上社宅の家賃は会社が8割を負担し、自己負担は2割です。敷金・礼金など入居時の初期費用と引っ越し代は全額会社負担で、全国に2か所の社員用マンションもあります。自宅コースは借上社宅の対象外となる代わりに、本人が世帯主の賃貸に住む場合は住宅手当が支給されます。

家族に関わる制度では、家族手当のほかに薬品使用料支給制度があります。日本調剤の薬局で調剤した薬代の本人負担額を会社が負担する制度で、被扶養者の分も対象です。

出典：日本調剤株式会社 薬剤師中途採用｜働く環境・福利厚生

育児との両立では、育児休業が最大2年間取得でき、育児短時間勤務制度は子どもが小学校1年生を修了するまで1日の勤務時間を最大2時間短縮できます。育児休業からの復職率は95%です（2025年度）。従業員の女性比率は74.4%で、えるぼし（2018年）、くるみん（2021年）、トモニン（2021年）の認定を取得しています。

退職金は3年以上勤務した人が対象で、退職一時金と確定拠出年金の組み合わせです。

新入社員教育とOJT

全員が受ける研修は3つあります。入社直後の4月から約1か月かけて行う新人集合研修、配属店舗でのオーベン・ネーベン制、5年間かけて進めるステップアップ研修です。

新人集合研修はオンラインと対面のハイブリッドで、オンラインでは保険制度や処方監査・疑義照会を学び、対面では服薬指導や患者さん応対のロールプレイを行います。

オーベン・ネーベン制は、新人（ネーベン）に指導役の先輩（オーベン）が1年間マンツーマンで付く仕組みです。配属店舗内のなるべく年齢の近い先輩が担当します。特徴は指導する側の設計で、教育専任部署が研修項目を定めて全社で統一し、オーベン向けの研修も用意されています。指導の内容が店舗や先輩の力量に左右されにくくなります。2年目からは自分がオーベンになり、教える側として知識を復習する流れです。

ステップアップ研修はe-Learningで5年間続き、1年目の主要医薬品300品目マスターから、5年目の財務諸表や介護、緩和ケアまで段階的に範囲が広がります。

認定薬剤師・専門薬剤師の取得支援

支援の仕組みは社内認定と外部認定の2本立てです。

領域別社内認定制度は、がん・緩和・認知症・糖尿病・腎臓病・在宅医療の6領域に設けられています。試験・小論文・症例提出で能力を評価し、難易度に応じて「JP-A級 指導薬剤師」「JP-S級 指導薬剤師」として認定されます。この社内認定の取得状況が、前述のステージ手当の判定材料になります。

外部認定については、がん・緩和・小児・心不全・HIVの5領域で勉強会・進捗管理・症例添削の支援があります。さらにがんと緩和には認定取得強化チームが置かれ、講習会や学会の参加費用を会社が負担し、病院実務研修の機会や合格者からの情報共有も用意されています。実績として、JASPO「外来がん治療専門薬剤師」の取得者は約100名です（2026年5月1日時点）。

支援を受ける前提になる研修認定薬剤師は、日本薬剤師研修センターの制度では申請日前4年以内に40単位以上の取得が必要です。単位の取得には講習会や学会への参加が欠かせないため、費用と時間を会社が負担するかどうかで実際の取りやすさが変わります。

参考：日本調剤「薬剤師 新卒採用」 ／ 公益財団法人日本薬剤師研修センター「研修認定薬剤師の認定申請」

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日本調剤が向いている薬剤師

専門性を高めたい人

前述のとおり大学病院の門前が中心で、希少疾病薬やバイオ医薬品といったスペシャリティ医薬品を扱う店舗もあります。専門領域に寄せた認定支援と組み合わせると、狙った分野の症例を集めやすい環境です。

出典：日本調剤株式会社 薬剤師中途採用｜キャリア紹介

病院での経験を積みたい場合は社外ジョブチャレンジ制度があります。日本調剤の社員のまま平均1〜2年間病院に勤務する制度で、病棟業務や抗がん剤ミキシング、注射薬の取り揃えに携わります。

給与は病院勤務前と変わらず、福利厚生もそのまま使え、夜勤や残業は原則ありません。派遣法とその施行令で認められている業務に限られるため、病院で担当できる業務の範囲には制約があります。

転勤を受け入れられる人

コース手当と借上社宅は、どちらも転居を前提としたコースにしか付きません。自宅コースは通勤圏が90分以内に収まる代わりにコース手当がなく、借上社宅も使えません（本人が世帯主の賃貸なら住宅手当が支給されます）。

額面の月給だけで並べると、判断を誤りやすい部分です。家賃の8割が会社負担になる分を足した「手元に残る額」で見ると、順番が変わることがあります。家賃8万円の物件に住む場合、会社負担は月6万4千円で、全国勤務手当の月4万円を上回ります。

評価に応じた処遇を求める人

勤務成績に基づく昇給、研修と資格に連動するステージ手当、外部認定の月5万円は、いずれも年次に関係なく処遇を動かせる要素です。若いうちに認定を取れば、その時点から月給に乗ります。

店舗以外の選択肢が広いのも特徴です。ヘルスケア推進部の商品企画や教育情報部の研修運営のように、薬剤師の経験を別の形で使う職種が本部に用意されています。

参考：日本調剤「薬剤師 新卒採用」

まとめ

日本調剤の年収を自分に当てはめて見積もるなら、平均額ではなく初任給の内訳と勤務コースから組み立てるのが確実です。

有価証券報告書の正社員平均年間給与571万3千円は全職種をまとめた数字ですが、保険薬局の薬剤師の平均約479万円を約92万円上回っています。年間休日121日と日祝を中心とした週休2日制、借上社宅の8割補助を合わせると、額面だけでは見えない差が出てきます。

判断が必要なのは、転居を受け入れるかどうかの一点です。全国勤務手当と帰省交通費、社宅補助は転居を伴うコースにしか付かず、自宅コースを選ぶと年収は抑えめになります。コースは入社後にも変更できますが、期間の縛りがあるぶん最初の選択が効いてきます。住む場所と年収のどちらを優先するかを先に決めてから、応募する店舗を絞っていくと迷いにくくなります。